ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: miR159a
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GAGCTCCTATCATTCCAATGA miRNA* TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GATTGGAAGCGGAGCTCCTATCATTCCAATGAAAGGCCCTTTCGCTGGGTTGGTACAGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTAGTCCTATCTCATCACCTGG
AGGGTTTATCTGAAAGAGAGGGTGAGATGAGTCATGAGTGGCCTGGTGTTTGGCTTGAGATAGGCTTTGTGGCTTGCATGACCGAGGAGCTGCACCGTCC
CCTTGCTGGCCGCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCGTCTTGA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase sbi-MIR159: 3e-34 PMRD pgl-miR159: 4e-55 microPC miR319: 2e-22 | UniProt no hits RFAM MIR159: 5e-33 | most similar mature miRNAs |
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