ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG miRNA* GAGCTCTCTTCCTTCCAATGA mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGCTGCTGCTTGGATTTGAAGCGGAGCTCTCTTCCTTCCAATGAAGGGTCGTTCTGAAGGGTGGTACAGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTATCCTATCT
CATCGGCTTTGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGTGAGGTCCGGTGAGATGATTGGCTTGAGATAGGCTTGTGGTTTGCATGGCCGAGGAGCTGCATCGTCCC
CTCTCCGACCGCTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCTCGATCCTCCCGTGTT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase sof-MIR159e: 1e-33 PMRD sof-miR159e: 1e-33 microPC miR319: 2e-16 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-24 | most similar mature miRNAs |
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