ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIR319
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGAAGCTCTGC miRNA* GGAGCTCCTATCTCTCCAATG mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
TCGGATGGCTGGATCGGAAGCGGAGCTCCTATCTCTCCAATGAAGGGTCGTTTTGATCGGGTGGTACAGCTGCTCGTTCATGGTTACCACTGACCTATCT
CATCACATGGAGGTTTATCCGAGTGTTGGGGAGAGGGAGATGTGCTCAAATCAGTAGCCTGGTATTGACTTTGAGATAGGCTTGTGGCTTGCATGACTGA
GGAACTGCACCATCCCCTTGCTGGCCGCTCTTTGGATTGAAGGAAGCTCTGCGTCTCGATCCCACAAGGC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase sbi-MIR159: 5e-30 PMRD pgl-miR159: 1e-30 microPC miR319: 3e-16 | UniProt no hits RFAM MIR159: 9e-29 | most similar mature miRNAs |
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