ABOUT THIS RECORDspecies: Picea glauca
miRNA family: miR3699
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Picea glauca Picea Pinaceae Coniferales Coniferopsida Coniferophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GACAGAAGATAGACTTTGGTC miRNA* CCAGAGTCCATCTCTGTCAG mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
GGCAAAGGTGTCTTGTTTCCAGTTGTTTCTTGACAGAAGATAGACTTTGGTCCTATGGAGAAACAGCCTTCGCGACTTCCTTTTTATTGATTACTCCTAT
TTCATGCAGTGGTAAGTAACAAGAAGGGCAAGGTTAAGGGCAAGTTTCGCCATATCAGGTGACCAGAGTCCATCTCTGTCAGGAAACAAGGATCAAGTAA
CAAACACTTG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase pab-MIR3699: 4e-30 PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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