ABOUT THIS RECORDspecies: Picea glauca
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Picea glauca Picea Pinaceae Coniferales Coniferopsida Coniferophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGCTTGAAGGGAGCTCCC miRNA* GCGCTCCCTTCAGTCCAACCA mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAGAGGTGACGGGGCGCTCCCTTCAGTCCAACCAAGGGCCACGTGGGGATGATTCAACTGCTGGTTCCTGGACTCTATTGTCTTGCAATGCTCGAGAAAC
GGTTTTGGTCTCAAGATAATAGTGTGCATGACACAGGAGTTAGATTGCCCTTACGGTGTTTTTATTTGGCTTGAAGGGAGCTCCCCGAATTCCTA
dot-bracket secondary structure
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AAGAGGTGACGGGGCGCTCCCTTCAGTCCAACCAAGGGCCACGTGGGGATGATTCAACTGCTGGTTCCTGGACTCTATTGTCTTGCAATGCTCGAGAAAC
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SIMILARITIES| miRBase pta-MIR159b: 7e-19 PMRD pta-miR159b: 7e-19 microPC miR159: 8e-96 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR159 from microPC (MNEST044993) |
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