ABOUT THIS RECORDspecies: Picea sitchensis
miRNA family: MIR946
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Picea sitchensis Picea Pinaceae Coniferales Coniferopsida Coniferophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CAGCCCTTCTGCTATCCACAT miRNA* GTGGATATGGAAGGGCTAGGT mismatches: 0 bulges: 2 |
pre-miRNA
TGAAGAAATTGATGTGTTCATATTGTACAGATGTGGATATGGAAGGGCTAGGTAACAGAAAATACAAAACCCATTTGATGCAGATTGCATAAGGGCCATC
TTATTGTAGATTGTTGGTTGTTTGAGATCAAGCAACTGTGTACCAGCAGCTGTATTTAGATGGCCATGCTCATTGGGTTACCTTTTGCTCTTTACCAGCC
CTTCTGCTATCCACATTCGTACTAATTTGTCCACATCAATTTCTT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase pta-MIR946b: 0.0000002 PMRD pta-miR946b: 0.0000002 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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