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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST002067
species:
Pinus taeda
miRNA family:
MIR952
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Pinus taeda
Pinus
Pinus
Pinaceae
Coniferales
Coniferopsida
Coniferophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
AACTGAGAATGCCATTGGTG
miRNA*
CTAATAGCACGCTTAGTTCA
mismatches:
3
bulges:
0
View larger
pre-miRNA
GAACTACTCGCGCATTG
AACTGAGAATGCCATTGGTG
GAGTAAGTACGTCAAGGGACGAAACAGAATTAATTTTGATTAACATTTTATTAACCTTCAACT
CTACCTTGGCTTATGGAAGTTCGTGAAGGTCACAGGGCAAGGACTAGTCTGCTGGTTGCTGCCACAGTCAATTGGGACTCTCCCAAGTTATTCTCAGCTG
CAGCATTCCGAAGTTATTCAATGTTGCAGCCGAGAATATTATGGGGACAGTCCATTGGTCACAACAGCCAGCCGATTACACCTTGTATGAGTGCCCCAAC
TGGTGTGAGTTTCATGAACTGCCAGAAGCCAAAACAGAGTTGCAACGCTAATAAAACATTATGCAAAATTAATTCCATTTTGTTGGTTGACATACTTCAT
CCG
CTAATAGCACGCTTAGTTCA
ATTTGCTAATGGTT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase
no hits
PMRD
pta-miR952b
:
0
microPC
no hits
UniProt
no hits
RFAM
no hits
most similar mature miRNAs
Identical with:
pta-MIR952b
from miRBase (
MNEST039443
)
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
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