ABOUT THIS RECORDspecies: Pinus taeda
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Pinus taeda Pinus Pinus Pinaceae Coniferales Coniferopsida Coniferophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGAGAGCTCCC miRNA* GAGCTTTCTTCAGTCCAACG mismatches: 0 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGAGGTTACGGGGAGCTTTCTTCAGTCCAACGAAAGGCCGTATAGGGATGATTCAACTGCTGGTTCATGGACTCTACTATCTTGTAATCCTCGAGGTTCA
GTATTGGCGGCAAGATAATGGTGTGCATGACACGGGAGTCGTATTGCCACTACGCTGTTTTTACTTGGATTGAAGAGAGCTCCCAGAAAGTCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase pta-MIR159b: 8e-102 PMRD pta-miR159b: 8e-102 microPC miR159: 8e-96 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
Identical with: pta-miR159b from PMRD (MNEST051554) |
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