ABOUT THIS RECORDspecies: Poncirus trifoliata
miRNA family: MIR171_1
source: miRNEST
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGAGCCGCGTCAATATCTCC miRNA* AGGTATTGGCGCGCCTCAATT mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGATCGACGGTTGAAGGGGAGAGTTGTAAAATGAAATCATCAAGGTATTGGCGCGCCTCAATTTAAAGACGTGGTTAAATGGGCATGATTAGCCATGTAT
TTTCATTGAGCCGCGTCAATATCTCCTTAATTATTTTGTAACTCTCTCCTCTATATCCTCGCCTT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase ctr-MIR171: 2e-89 PMRD vvi-miR171b: 0.00000000000004 microPC miR171: 5e-41 | UniProt no hits RFAM MIR171_1: 0.0000000000007 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR171 from microPC (MNEST046593) |
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