ABOUT THIS RECORDspecies: Poncirus trifoliata
miRNA family: miR319b
source: miRNEST
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGAGCTTTCTTCGGTCCACTT miRNA* TTGGACTGAAGGGAGCTCCCA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTGTTGATTTTGATTAAGCTGGGAGCTTTCTTCGGTCCACTTATGGGTGGCAATAGGATTTAATTAGCTGCTGACTCATTCATCCAAATACTTAGTAAAG
GGTCGAAATGGATACCCAGTAAATGAGTGAATGATGCGGGAGACAAATTGAATCTTAAGCTTCCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCATTGCTCGCTA
ATCTTATC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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TTGTTGATTTTGATTAAGCTGGGAGCTTTCTTCGGTCCACTTATGGGTGGCAATAGGATTTAATTAGCTGCTGACTCATTCATCCAAATACTTAGTAAAG
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SIMILARITIES| miRBase ctr-MIR319: 6e-103 PMRD ptc-miR319a: 5e-51 microPC miR319: 8e-93 | UniProt no hits RFAM MIR159: 9e-50 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR319 from microPC (MNEST045644) |
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