ABOUT THIS RECORDspecies: Poncirus trifoliata
miRNA family: MIR398
source: miRNEST
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGTGTTCTCAGGTCACCCCT miRNA* GAGTGAACGTGAGAACACAGG mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
GCAACAGATGTGAAACCCCAGAGGAGTGAACGTGAGAACACAGGGTGGCGTTGGCTTAAATTTGATTTTGCATTGCTGCTGCCTGCTCCTGCCATGCCAT
ACATTAAATTAAAAAAGATTGTATGTGGCCAACGCACCTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTGGGAATTCAATTGTCAAT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase csi-MIR398: 3e-67 PMRD vvi-miR398a: 0.0000001 microPC miR398: 1e-75 | UniProt no hits RFAM MIR398: 0.00000001 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR398 from microPC (MNEST046328) |
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