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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002198
species: Populus tremula x Populus tremuloides
miRNA family: MIR167
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Populus tremula x Populus tremuloides Populus Saliceae Salicaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TGAAGCTGCCAGCATGATCTG

miRNA*
 GGTCATCTAGCAGCTTCAAT

mismatches: 1
bulges: 1
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pre-miRNA
 CTCAATTTGTCTAATATGTTGGTTTGAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTAATGAACGTGTTACTCTCATTTATATATATATTAACATTAATCTTA
TAGCAGTATCTGTAGGTAGAAAAAATTTAATGTTGTCAAAGATATATACTGAATCGTGGTTGCTAGGTTTGTATTACTAGTTTAGGATGCATGTTTTTGA
TCTTATGATGATCAATTGCTTGTGAGTTCCTAGGCAATGAAAACAGAATATATACTGGTGATTTTTCCCAGTAAAATTGTCGAGAAAAGGGAATTGCACT
AATAGGGAAGACGCATAGGTAAACTTGTATCTAAATGGTATATGTATNTTCCAGGCAAAAGGGTAGAAACCTAATNAGAAACTAGCTTGAACTCAGAGCT
ATAAAAGTATATGGTTCCATCAGGTCATCTAGCAGCTTCAATCACTCACTCACAAACAGC

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase gma-MIR167c: 2.0E-12

PMRD ppl-miR167b: 0

microPC miR167: 2.0E-5		UniProt no hits

RFAM 1MIR167_1: 0		most similar mature miRNAs

Identical with: pts-miR167 from PMRD (MNEST054373), ppl-miR167b from PMRD

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
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