miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse

Back to search results



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002249
species: Prunus persica
miRNA family: MIRf104
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Prunus persica Prunus Amygdaleae Spiraeoideae Rosaceae Rosales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
GTTCGGTTTGAACCGGTTTCG

miRNA*
GAACCGGTCCAAACCGGTCCG

mismatches: 3
bulges: 0

View larger
pre-miRNA
AAAAATTTCAAAAACTGTCCGGTTCGGTTTGAACCGGTTTCGGTCCAGTTCCGGTTCCGGTTCGATTTTGAACAGGATTATAAAAATTATTTTTTTAAAT
TGCTTTTTAATACAATTCTCAACTGAAATATTATTTTTTTACTTGAAAATTAACAAATTATTCAATTTCATATAAAAAATAAATATTAAAGTGAGAAAAG
AGAGATATTTTGACATTGAACTTGGATAAATATTATATTTTTTTTAGTGAAATTAAAAATATAACATTAAATATAAATATATATTGAAATTATATATTTT
TTTAGTTTCACCGGTTCGGTTCGGCCCGGTTCAGTTTTTGAAGACATGGAACCGGATCCAGAACCGGTCCAAACCGGTCCGGTTCAGTTTTTGACCGGT


dot-bracket secondary structure
.......((((((((((.((((.((((((((.((((((((.((......((((((((((.(((((..((((((.((....((((((.....))))))(((
..((((((.......((((((.((..((((((..(((((((..(((((.................)))))..)))))))..))))))..)))))))).))
))))..)))((((.((((((((.(((.(((((...)))))..))).(((((((((((((.(((......((((((....)))))).........))).))
))))))))))).)))))))))))).)).))))))...)))))....)))))))))).)).)))))))).)))))))).))))..)))))))))).....



SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD ptc-miRf12125-akr: 0.0003

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record





Liczniki na strone;