miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse

Back to search results



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002260
species: Prunus persica
miRNA family: MIRf104
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Prunus persica Prunus Amygdaleae Spiraeoideae Rosaceae Rosales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 GTTCGGTTTGAACCGGTTTCG

miRNA*
 GAACCAGTCCAAACCGGTCCG

mismatches: 3
bulges: 0
View larger
pre-miRNA
 AAAAATTTCAAAAACTGTCCGGTTCGGTTTGAACCGGTTTCGGTCCGGTTCCGGTTCGGTTCGGTTTTGAACCGGATTATAAAAATTATTTTTTTAAATT
ACTTTTTAATACAATTCTCAACTGAAATATTATTTTTTTACTTGAAAATTAACAAATTATTCAATTTCATATAAAAAATAAATATTAAAGTGAGAAAATA
GAGATATTTTGACATTGAACTTGGATAAATATTATGTTTTTTTTAGTGAAATTAAAAATATAGCATTAAATATAAATATATATATTGAAATTATATATTT
TTTTAGTTTCACCGGTTCGGTTCGGCCCGGTTCGGTTTTTGAAGACATGGAACCGGATCCGGAACCAGTCCAAACCGGTCCGGTTCGGTTTTTGACCGGT


dot-bracket secondary structure
.......((((((((((.((((.((((((((.((.((((((((((((((((((..((..(((((..(((((((((....((((((.((.(((...))).)
).))))))......((((((.((..((((((..(((((((..(((((.................)))))..)))))))..))))))..))))))))((((
....))))((((.((((((((.(((.((((.....))))..))).(((((((((((((.(((......((((((......)))))).........))).)
)))))))))))).)))))))))))).)))))))))...)))))))..)))))))))).)))))))).)).)))))))).))))..)))))))))).....



SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record




Liczniki na strone;