ABOUT THIS RECORDspecies: Prunus persica
miRNA family: MIR2673
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Prunus persica Prunus Amygdaleae Spiraeoideae Rosaceae Rosales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCTCTTCCTCTTCCTCTTCCT miRNA* GAGGAGGAGGAAGGAGGGGGC mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
GCTGGAGAAGCTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCTGTAAATGAAAGATGGAGCTCTGTTTGAGCTTGGGAGATGTGCAAGCTCCTGCAGAGC
CATTTGGGTTAGTCTCATCATCATCATCAGAGAAGCCTCGTGATGATCGGGTCATCATGGCCGCCTCCAAAACGACAGGGTTTTGCATGAGCTTATCAAT
CGGTCCAAGCTGTGACAGCAGTACGAGTACCAGTCCTAGAGAAGCAGATCAACAACTTGATAGAAATGATCATCAAAATGATGATGATCCAAGTAGGTTT
AGTGCTGCTTGTGGTTCCAAATCAGATGTACCAGTCCAACTTGATCTTCTCCCCCACACTCCTGTAGCCCCCAGAAGCAGCAGCCATGGCTTCCCTTGGC
CCACTCCTTCAGATCAAAACGTAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGAGGGGGCTCATCAGA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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GCTGGAGAAGCTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCTGTAAATGAAAGATGGAGCTCTGTTTGAGCTTGGGAGATGTGCAAGCTCCTGCAGAGC
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CCACTCCTTCAGATCAAAACGTAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGAGGGGGCTCATCAGA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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