ABOUT THIS RECORDspecies: Raphanus raphanistrum
miRNA family: MIR437
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Raphanus raphanistrum Raphanus Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GAAGTCAGAGAAGTTTGATGA miRNA* GTTTAATTTCATTGATTTTTG mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGCAGAAACCTAAGATCGAAATCACGCTTGGGAAGTCAGAGAAGTTTGATGAACTAATGGCTGCAGCCAATGAAGAAAAAGAAGCTGCAGAAGCTCAGGT
CCAGAGCTGAGCATAGCCTTCTTATGTTATGTTTCATTTCATGGGTCTTTCTCCTGCTTGATGCTTAATATTATTTGTTTAATTTCATTGATTTTTGGCT
GAATTTGAGTTGTTATGTTTTGGAT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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