ABOUT THIS RECORDspecies: Saccharum officinarum
miRNA family: MIRf75
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Saccharum officinarum Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GTCGAGACGAATCTTTTGAGC miRNA* TCAAAACATTCGTCTCACAA mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
AAATTTTACAAGATTCCTCATCACATCGAATCTTTGGACGCATGCATGGAGTATTAAATGTAAGTAAACAAAATAACTAATTGCACAGTTTGTCTGTAAA
TGTCGAGACGAATCTTTTGAGCCTAGTTAGTCCATGATTGGATAAATTTTACCAAATAACAACGAAAAGTGCCACAGGGACTTTACACCAACTTTTACAC
CATCTAAACACTACCTAAATCATACTATCATGTGGGATAGCAGCTGGTTGAGCAACAAGTTCAATTATACATACGTGCGTTGTTGTTTAAGCTACCTAAT
AGTACTGTAGCCGCCCCTGTGAAATTAAGGCTGTGTTTAGATCTAAATTTTGAAGTGCCCAAATACACTGTAGCCATTCGGTTGTATTTGGTAATAATTG
TCCACCATTGACTAATTAGGCTCAAAACATTCGTCTCACAAAGTACAACCAAACTGTACCATTAGTTTTTGATTTTATTCACATTTAGTATTTCATGCAT
GTATTCGAAGGTTTGGTGTGACCGGAAAATCTTTTTTTT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR2124h: 0.000000000002 PMRD osa-miRf11301-akr: 0.000000000008 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
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