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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002536
species: Saccharum officinarum
miRNA family: MIR437
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Saccharum officinarum Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 AAAGTTAGAGAAGTTTGACTT

miRNA*
 GTTAAACTTCTCTAACTGTGA

mismatches: 3
bulges: 0
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pre-miRNA
 TGCTTGTCTAAATATAGTATTTCCTCTGTTCCAAATTATAGTTTGCTTTGGCTTTGTCCAATGTTAAACTTCTCTAACTGTGACCAAATTTTTGGAAAAA
TATATTAACATCTGCAAGCTGAATTAAATACACTATCAAGACATGGAGAATTTAATGAAACTAATTTGATGTCATAGATATTGGTGTATTTTTCTATAAA
CTTGGTCAAAGTTAGAGAAGTTTGACTTAGGATAAAGCTAAAGTGAACTACTCTATAATTTAGGACGGAGGGAGTAATTACTATTCC

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase sbi-MIR437u: 2e-63

PMRD sbi-miR437u: 2e-63

microPC miR437: 3e-22		UniProt no hits

RFAM MIR1122: 0.0003		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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