ABOUT THIS RECORDspecies: Saccharum officinarum
miRNA family: MIR437
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Saccharum officinarum Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GAAGTTAGAGAAGTTTGACAT miRNA* GTCAAAACTTTTCTAACTTTGA mismatches: 2 bulges: 1 |
pre-miRNA
TAAGAAACAGCCAATGATACTCCTCCTTTTCTAAAATGCAGGGCGTTTTACTTTTGTCCTAAGTCAAAACTTTTCTAACTTTGAACAATTTTATAGAAAA
ATATATTGACATCTACAATACCAAATAAGCGCACTGTCAAGACATTTCATGGTGGATTTAATGAAGCTAATTTGATGTTTCAGATGTCTGTGCAATGTTC
TATACACAGTGAAGTTAGAGAAGTTTGACATCGGGCAAAAATAAAATGACATACATTTTTGAATGGTTGGGGTAGTATACAATGGACTAC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase sbi-MIR437f: 5e-21 PMRD sbi-miR437f: 5e-21 microPC miR437: 0.00000002 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
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