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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002559
species: Saccharum officinarum
miRNA family: MIRf75
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Saccharum officinarum Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 CACGAGACGAATCTTTTGAGC

miRNA*
 TCAAAACGTTTATCTCGCAAA

mismatches: 4
bulges: 0
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pre-miRNA
 ATTTTTAGACACATGCATGGAGTATTAAATGTAGGTAAAAAAAAAACTAATGGCACAGTTTGGTTGTAAATCACGAGACGAATCTTTTGAGCCTAGTTAG
TCCATGATTGGACAAAGTTTGTCAAATACAAACGAAACGTGCTACAGTGTCCAGATTGCAAAAATTTGCAATCTAAACAAGGCCTAACTTGCAGTCGCTG
GATTCCCTGGGACACCTGCCATCGTTACAAAGGCTCAGGCTGTGTTTAGTTCCTAAATTTGGAGTGACAAAATTCACTGTAGCGACACTATAGCATTTCG
TTTGTATTTAGTAATAATTGTCCAACCGTTGACTAATTAGGTTCAAAACGTTTATCTCGCAAAGTACAACCAAACTGTGCAATTAGTTTTTGATTTTATC
CACATTTAGTACTTCATACATGTATCGCAAG

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR2124a: 0.0000000004

PMRD osa-miRf11301-akr: 0.000000000006

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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