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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002562
species: Saccharum officinarum
miRNA family: MIRf10
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Saccharum officinarum Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TTAGGCTTAATAGATTCGTCT

miRNA*
 ACAAATCTATTAAGTCTAATA

mismatches: 1
bulges: 0
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pre-miRNA
 TGATACCAATTAGGAGTATTAAATATGGGCTAATTACAAAACTAATTACACAGGTTGAGGCTAATTTGCGAGACAAATCTATTAAGTCTAATAACTCCAT
GATTTGCGAGACGAATCTATTAAGTCTAGTAAGTCCATGATTTTGGCAATGTTGTGCTACAATAAACATTTGCTAGTTAGAAATTAATTAGGCTTAATAG
ATTCGTCTCGCTAATTAGTCTACCCATGTGCAATTAGTTTTATAATTAGCTCATATTTATTCTTTCCAATGCGACGC

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR2124e: 0.000000000000001

PMRD osa-miR442: 0.0000000000003

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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