ABOUT THIS RECORDspecies: Saccharum officinarum
miRNA family: MIRf34
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Saccharum officinarum Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATCTGGGACAGAGGGAGTAGA miRNA* TACTCCCTCCATCCCAGAATG mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
ACACTACTCCCTCCATCCCAGAATGTTAGACGTTTTAGGATTCAAAGTTTGTCTCAAAACGCTTGACGTTATAGCCTAAATCGTGGGTCCCACTCTAGCC
TAATCAAGACGTCAATCATCCATCCACCGTTGTCCCAGCGCTTTCCGTCCACTAGCCTAGATGCTAATTGGTGGAGCAGAGCAAAAGTGGTGGCCAGGCA
TGAAACCAAGGCAATGAATGCGCATGTCATTTCAATTTTTGTAGGGGTATCAGGGACTTTTATCTCCGCCATTGGTTACAGGTCCCAATCCTATGACGTC
AAGCAATCTGGGACAGAGGGAGTAGATCCCTAATG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD osa-miRf10339-akr: 0.0003 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
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