ABOUT THIS RECORDspecies: Saccharum officinarum
miRNA family: MIR2504
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Saccharum officinarum Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGACCAAGTTTATAGAAAAA miRNA* TTTATCTGAACTTGGTCATAG mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAGAACAATGTATGTCGATTTAGTTTGCTCCTAAGTGAAAGCTCTCTAACCTTGACCAAGTTTATAGAAAAATACACCAAAATCTACAACATTAAATTAG
TTTAATTAAAAATCACCATAAAATGTCTTGTCAGTCTATTTATTTGATGTTCTAGATGTTAATATATTTTTATCTGAACTTGGTCATAGTTAGACGTGTT
TGACTTATGACCAAACTAAAACGACATACATTTTGGA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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AAGAACAATGTATGTCGATTTAGTTTGCTCCTAAGTGAAAGCTCTCTAACCTTGACCAAGTTTATAGAAAAATACACCAAAATCTACAACATTAAATTAG
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SIMILARITIES| miRBase bdi-MIR5169: 0.000000000000003 PMRD sbi-miR437u: 0.0000000000002 microPC miR437: 0.000000000003 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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