ABOUT THIS RECORDspecies: Saruma henryi
miRNA family: MIRf1481
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Saruma henryi Saruma Aristolochiaceae Piperales magnoliids Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGATGCTGCATCGGCAATAAG miRNA* GTTTGCGGGTGTGGCATCATC mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAGATCTCTGTAGAGGGAAGCACAGTCACTGTTTGCGGGTGTGGCATCATCAAGATTCACAAAACTTTGAAAGGGGGTGTTGAGTGGCAGTGCATGAGATG
AGGTGGTTGTGGATGGTGGCCCCTCACAGTACCCCCTCGAGATGGGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATAAGTGACTACTTTTTTAAGCTGCAAACC
A
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR172e: 2.0E-10 PMRD ptc-miRf11917-akr: 2.0E-10 microPC miR172: 4.0E-5 | UniProt no hits RFAM 2mir-172: 3.0E-9 | most similar mature miRNAs |
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