ABOUT THIS RECORDspecies: Saruma henryi
miRNA family: MIRf1481
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Saruma henryi Saruma Aristolochiaceae Piperales magnoliids Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGATGCTGCATCGGCAATAAG miRNA* GTTTGCGGGTGTGGCATCATC mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGATCTCTGTAGAGGGAAGCACAGTCACTGTTTGCGGGTGTGGCATCATCAAGATTCACAAAACTTTGAAAGGGGGTGTTGAGTGGCAGTGCATGAGATG
AGGTGGTTGTGGATGGTGGCCCCTCACAGTACCCCCTCGAGATGGGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATAAGTGACTACTTTTTTAAGCTGCAAACC
A
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR172e: 0.0000000002 PMRD ptc-miRf11917-akr: 0.0000000002 microPC miR172: 0.00004 | UniProt no hits RFAM mir-172: 0.000000003 | most similar mature miRNAs |
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