ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum melongena
miRNA family: MIRf1669
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Solanum melongena Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AGTCACTGCTTGCCATTGCAC miRNA* GCAGTGCCAAGCATTATGATTCA mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
AAATTAGAAGCAGTTCCTCCAAGTCACTGCTTGCCATTGCACGAAAGACCAGTGGATCCAGTTGAAATTGTGAACACTATTCCAGTAATTGATTTGGGAA
AAGCTAAGGGGGATGAACGACCTGCTGTCGTTCAACAACTTATGAAAGCTTTTGAAGAATATGGGTTTTTTCAGATAATCAATCATGGAGTACCCGAAAA
ATTGATGGAAGAGGCAATGAAAGTGTACAAGGAATTTTTCAGTCTGCCAGCGGAAGAAAAAGAGAGATATGCAAAGGATGCAGCAAATAATACAGCAACA
GGTGCAGCGAAAATGTACAGTAGCAGTGCCAAGCATTATGATTCAGAGGAGCATCGATACTGG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|P24397|HY6H_HYONI: 5e-16 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
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