ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum torvum
miRNA family: MIR169
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Solanum torvum Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TAGCCAAGGATGACTTGCCTA miRNA* GGCAGTTATCCTGGCTATA mismatches: 0 bulges: 2 |
pre-miRNA
TCTGAAATGTTAAGAAGAGAGACCTTACCTGAAGTGAAGAGTCTTTGTTTATTAGCCAAGGATGACTTGCCTACATACCTTTCCTCCCACAAGGATATTAT
TTCTCTAATTTCCCTTTTGGGGTTGCTATGCTAGGCAGTTATCCTGGCTATATTGACAGGCTATTCCTCATCATGTTAGGCCTCTTCTTCTCATAGTTAT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase tcc-MIR169g: 2.0E-7 PMRD aqc-miR169a: 7.0E-7 microPC miR169: 4.0E-5 | UniProt no hits RFAM 5MIR169_5: 8.0E-7 | most similar mature miRNAs |
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