ABOUT THIS RECORDspecies: Taraxacum kok-saghyz
miRNA family: MIR166
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Taraxacum kok-saghyz Taraxacum Crepidinae Cichorieae Cichorioideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCGGACCAGGCTTCATTCCCC miRNA* GGAATGTTGTTTGGCTCGAGG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTTCTTTTGCGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCACTAGAGAGCTTAGATCTCTCTCTCTATCTCTATCTCTATATACATCTATACATATAGATACAGAT
ATATGTATCTATCTATGATGTTATAATTATGCTCAATTGGTCAACGGATCCAACATCCATGGTCTTTGTTGATTAATGAGCTTTAGATGAATCTTGATCG
CTGGATCTGGTGTACTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTGT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR166a: 8.0E-10 PMRD ptc-miR166a: 8.0E-10 microPC miR166: 8.0E-7 | UniProt no hits RFAM 6mir-166: 9.0E-7 | most similar mature miRNAs |
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