ABOUT THIS RECORDspecies: Theobroma cacao
miRNA family: miR399c
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Theobroma cacao Theobroma Byttnerioideae Malvaceae Malvales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGGTACGTCTCCTTTTGCAGC miRNA* TGCGGAAGATATGTGCCCGA mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
ATCGCTAGTCAGAGTTCAATTGGGTACGTCTCCTTTTGCAGCTACTTTTGCTTCTTTTTATTATTCTCCTTGTCTTATGGCAGTTCAAACCAATCACAAC
ATGTAACATTGGTCAAGGAGTTATAGTATTTACCTTAGAATTCAGGATTAATTAGTCCAAAGTACAGTCATATGACATGGTGTGATTGGTAATTGCAGGA
ATGCAAAAAGTGGTAGTTGCGGAAGATATGTGCCCGAACTCAATGTTTATTGAAC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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