ABOUT THIS RECORDspecies: Trifolium pratense
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Trifolium pratense Trifolium Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCATCGTCATCATCTTCATCA miRNA* NNTGTGGATGTGGCGNTGAAG mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
TCATCTTCAAACTCTCCATCATCATCGTCATCATCTTCATCATCTCCTGCAGCCCGGGGGATCCACTAGTCTAGAGCGAGCCCCCCCTCGAGGTCGACGG
TATCGATAAGCTTGATATCGTTCAGAGGGGATTTTGCTTCCCTGATCAGACTGTCTAGTAGGCTTCTCCAGAGTTATGAGTGATGTTGACTCCCCATGAT
TTCTATCAGGTTGGATCTCCATCCATTTCTCCTTGTCCATCTCAGTTGTGTGTTAAGCAATTACCACAAGATTATGTGTTAACTTTTCAACTAAATCTTT
TAAAACATGACATTCTCCAACAACAGCCTTCTCTATGTCTGATTGGCATCCAAAGATCCAATTTCAGGGAAGATTTCAAACATGCAAGATCAAAATTTGA
GGAATTGAACCCACCATAGAAGCTTTTGAAATCGAAAGAATGAATCGGCGAGGATGCTTCACTGAGTGAGAAGCGCGNAAGAATAAAGGCNGCGGACAAT
TTCGAGTGATTTGTANGTGTGATGNNTGTGGATGTGGCGNTGAAGGAGAGATGGTGTGGTGGC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD sbi-miR169d: 0.0001 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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