ABOUT THIS RECORDspecies: Trifolium pratense
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Trifolium pratense Trifolium Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GTACTCCCTCCGTCCCAAAAT miRNA* TTTGGGACGGAGTAGTATGT mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
AACTTCTGTGCGAAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATATAAGCAAAAATTGGTCAATGAAAGTTGATGTATTTGGTTTAAAATTTAGTCCAGATACATTCACT
TTTGTTGACCTCCTTTTGCTTATATTTTGGGACGGAGTAGTATGTCGTATGAAGA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR818d: 8.0E-6 PMRD osa-miRf10603-akr: 8.0E-9 microPC miR1439: 5.0E-7 | UniProt no hits RFAM 2MIR1122: 2.0E-25 | most similar mature miRNAs |
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