ABOUT THIS RECORDspecies: Trifolium pratense
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Trifolium pratense Trifolium Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCATCATCATCATCATCATCA miRNA* GAAGTGATGGTGGTGGTGGGG mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
ATTGGAAGCTTTGGAAGTGATGGTGGTGGTGGGGAAGTTAGGTTTCCTTGGGAGAAATCAGTGGTGGTGGATGAAGAGGAAGAGGAGAGGAGGGTTTTCC
TGCAGCCCGGGGGGATCCACTAGTTCTAGAGCGGCCGCCACCGCCTCCTCCAGCTCCTCCCTTCTTCCCTTCAGATCCATCTCCCTTGGAACCAATTTGT
TTCCTTTGTCCAGTGAATTGGGAGTCGAACTGATATCAACCCAGTCGGAGTTGTGACAAACTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCAT
dot-bracket secondary structure
..(((......(((..(((((((((((((((((...((((...(((((((((.((.((((((((.(((((((((((.((((((((.((((((((((....
...))))).((((((....(((....))).((((......)))).))))))...))))).)))))))))))))..)))))).)).((((..(((((((..
..............)))))))...)))))))))).))..)))))..))))...))))...)))))))))))))))))..)))......))).
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
ATTGGAAGCTTTGGAAGTGATGGTGGTGGTGGGGAAGTTAGGTTTCCTTGGGAGAAATCAGTGGTGGTGGATGAAGAGGAAGAGGAGAGGAGGGTTTTCC
TGCAGCCCGGGGGGATCCACTAGTTCTAGAGCGGCCGCCACCGCCTCCTCCAGCTCCTCCCTTCTTCCCTTCAGATCCATCTCCCTTGGAACCAATTTGT
TTCCTTTGTCCAGTGAATTGGGAGTCGAACTGATATCAACCCAGTCGGAGTTGTGACAAACTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCAT
dot-bracket secondary structure
..(((......(((..(((((((((((((((((...((((...(((((((((.((.((((((((.(((((((((((.((((((((.((((((((((....
...))))).((((((....(((....))).((((......)))).))))))...))))).)))))))))))))..)))))).)).((((..(((((((..
..............)))))))...)))))))))).))..)))))..))))...))))...)))))))))))))))))..)))......))).
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
