ABOUT THIS RECORDspecies: Capsicum annuum
miRNA family: MIR1127
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Capsicum annuum Capsicum Capsiceae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AAATACTTCCTCCGTCCCATT miRNA* TGGGACGGATAGAGTAGTATA mismatches: 5 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAATCATAATCAAATACTTCCTCCGTCCCATTTTACTTGTTCTATTTTACTTATCAAGCCAAGACAATTTTTTTTTCATTATACCTTTAGTGTAATTGAT
TACTCCTTATTATTAGCATTCTTGAAAAATATTGTAAAGAGTAGTACCGTTAAAAATATATTATTAATTTTTTTTTGTGTTTTGATATTAGTCATCCATT
AATATTGAAACTAACAATAAGACACAATTAAGAGGGGTAAAGTGATAAAGTTATATTATCAATCATTGTTTTTAATAACTGTGTCATTTCAATTTGAGAC
GAATAAAATGGGACGGATAGAGTAGTATACTATTTAT
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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