ABOUT THIS RECORDspecies: Centaurea maculosa
miRNA family: miR394a-3p
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Centaurea maculosa Centaurea Centaureinae Cardueae Carduoideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTGTTGGTATCTCTTTGTAAA miRNA* AATAAAGGGTTTCCTGCAGAT mismatches: 5 bulges: 0 |
pre-miRNA
TCAATTCATGGCGGTTTAATAAAGGGTTTCCTGCAGATTTCTTTGGCATTCTGTCCACCTCCCTATTCATGTATCAAACCCCACTATAGGAAAAGCTAAA
AAGAAAGAAAAAGAAAAAGAAACCCGTGTGTGTAATTAGGGTTTCGTAGTTTGCTAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAGAATCTAAGGCAAGATTTTTT
CTTTTGTGTGTGTAATTAGTGTGTGGAGGTGGACATACTGTCAACGGAGCTCTGTTGGTATCTCTTTGTAAAACCCTCTTGAAGTT
dot-bracket secondary structure
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR394b: 0.000000000000004 PMRD ptc-miRf10096-akr: 0.000000001 microPC miR394: 0.00006 | UniProt no hits RFAM MIR394: 0.00002 | most similar mature miRNAs |
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