ABOUT THIS RECORDspecies: Centaurea solstitialis
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Centaurea solstitialis Centaurea Centaureinae Cardueae Carduoideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTCCTTGAAGTCCAATAG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTGTGAGGTGTTGTGGTTGAAACCAGTGGAAGTAGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTGAGTGGGAAGATAGTGCTGCTGGCTTATGGATTCCTCAA
GTCCTATCTTTATGGTTTTGTATAGGCTTTGTGGCTTGCATAACCCAGGAGCTTTATTACCTTACTTTATGATCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTAC
ACCCTCTATTATTTCTATCCAAACCCCAT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase vvi-MIR159c: 5.0E-11 PMRD vvi-miR159c: 5.0E-11 microPC miR159: 1.0E-79 | UniProt no hits RFAM 9MIR159: 9.0E-10 | most similar mature miRNAs |
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