ABOUT THIS RECORDspecies: Brachypodium distachyon
miRNA family: MIR1132
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Brachypodium distachyon Brachypodium Brachypodieae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AATTATGGAACGGAAAGAGTA miRNA* CTCCCTCCGATTCTAAATTGT mismatches: 2 bulges: 2 |
pre-miRNA
TATGTATACAGTACTCCCTCCGATTCTAAATTGTTATCAAAATATTACAGGTATTTAGAGACTTTTTAAGAATAGATACATCCATATTTGAGCAAATTTGA
GACAAGAATTTAGGATCGGAGGAAGTACATGTTAACTACTCCATCTCCGTTCCATAATTCTTGTCTCAAATTTGTCTAAAAGTGGATGTACGTATCTTTT
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase bdi-MIR5183: 4.0E-12 PMRD bdi-miR1135: 6.0E-11 microPC no hits | UniProt no hits RFAM 2MIR1122: 2.0E-32 | most similar mature miRNAs |
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