ABOUT THIS RECORDspecies: Helianthus annuus
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Helianthus annuus Helianthus Heliantheae Heliantheae alliance Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCATCATCATCATCATCTGGG miRNA* CAGATTGTGACGATGATTTCATG mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
TCTTAACAGTATCATCATCATCATCATCTGGGTTTGATCAGTTTCTTCAACAATCATCATCATCAAACTCATGGGTGCTTGTGTTTCAAATCACCAGAAA
CCTTCTGGGAAGAAGGTTCAGGCGTTATATAATGGGTCTAATGATATTGTTAAACCTCCCATCATAAATGGTGATCTTGCTAATAAGTCTAAGTGGTCTC
CCTCCAAATCAGCACCTTCTTTTCAAGATTTTGGTAGTAAAGAGGAGACGTTTTTTGACTCACAAGCATGGTTAGATTCAGATTGTGACGATGATTTCAT
GAGTGTTAA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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CCTTCTGGGAAGAAGGTTCAGGCGTTATATAATGGGTCTAATGATATTGTTAAACCTCCCATCATAAATGGTGATCTTGCTAATAAGTCTAAGTGGTCTC
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|Q9LK32|Y3721_ARATH: 0.00001 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
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