ABOUT THIS RECORDspecies: Arabidopsis thaliana
miRNA family: MIR319
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Arabidopsis thaliana Arabidopsis Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT miRNA* AGAGCTTTCTTCGGTCCACTC mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGTGGAGGAAGAGAGCTTTCTTCGGTCCACTCATGGAGTAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCAAATACCAAATGAAAGAATTTGT
TCTCATATGGTAAATGAATGAATGATGCGAGGGACAAATTGAGTCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTATTTTTAT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase aly-MIR319b: 3e-95 PMRD ath-miR319b: 3e-92 microPC miR319: 1e-91 | UniProt no hits RFAM MIR159: 4e-101 | most similar mature miRNAs |
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