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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST003335
species: Arabidopsis thaliana
miRNA family: MIR167
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Arabidopsis thaliana Arabidopsis Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TGAAGCTGCCAGCATGATCTG

miRNA*
 GGTCATCCTGCAGCTTCAGT

mismatches: 1
bulges: 1
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pre-miRNA
 TTCTCATTCTTTTTCAATTATCTATGTTGGTTTTTAGAAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTAATCGCTACATACGACATACACACATCACTAAACTT
CTTTATAATTTATGCACACACATACAGCTCTTAATGGCCACAACTCAAAGTTATAATTAGTGCATGATCTCTAGTTATTTGACTGCTTTTAATATATGTT
TATGGATTCACGCATGTGTGTGTATGTACATAATTTACATGCATGCACTTTGTGTATGGTACACATCAATTTGAACCCGTTCAAAATTCTGTTTTTATTA
GTATATATATAGATGTATGTGGTGTGTGTGTCAGTGTGTGTGTGTGTTTATAGATAGTAGTACTAGGTCATCCTGCAGCTTCAGTCACTAAATCACCAAC
AATGCAAAAAAGATATAAACACT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase ath-MIR167d: 2e-166

PMRD ath-miR167d: 2e-166

microPC miR167: 0.00002		UniProt no hits

RFAM MIR167_1: 2e-160		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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