ABOUT THIS RECORDspecies: Glycine max
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Glycine max Glycine Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AGCTGCTTAGCTATGGATCCC miRNA* CTTCCATATCTGGGGAGCTTC mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAACATTAATTAAAGGGGATTATGAAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAATTGAGGATCTTACTGGGTGAATTGAGCTGCTTAGCTATGGATCCCACAGTTCT
ACCCATCAATAAGTGCTTTTGTGGTAGTCTTGTGGCTTCCATATCTGGGGAGCTTCATTTGCCTTTATAGTATTAACCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTC
TACACCCTTCTCTTCTTTTCTCTC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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TACACCCTTCTCTTCTTTTCTCTC
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SIMILARITIES| miRBase gma-MIR159a: 3e-117 PMRD gma-miR159a: 3e-117 microPC miR159: 2e-96 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-18 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR159 from microPC (MNEST045395) |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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