miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse

Back to search results



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST003449
species: Glycine max
miRNA family: MIR1520
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Glycine max Glycine Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 ATCAAAACATGACACGTGAAA

miRNA*
 TCACGTATCATGTGGATGT

mismatches: 3
bulges: 2
View larger
pre-miRNA
 TTGAATCAAGGCAAAATTACATTTTTGATTCTCCAGTTTGTCTTCAATTTCAAATTTTGTCCCCCATTAAATTAATTCACAATTTTTTTTTCTCCTACTT
TTTAAAATCATGCAATGTTGGTCCCTCAACCCACAATTGGACGTTGATTGTTACAAAGTGACATTGACTACCATGTGTCACTTTCTTATTGAATGATGAT
TGTCACGTATCATGTGGATGTTAATTCCATAAAAGATGAAATACATTGTTGTTTTCATTGACCCATCAAAACATGACACGTGAAAGTCATCATTCAATAA
AAAAGTGACACGTGACAATAATCAACGTCACCTTGTAACCCGTTAAGGTTCAAGTGTGGACTGGAGGACGAACATTACATGATTTTATAAAATAAAAAAA
TAATATTTGTGAATTAATTTAGTGGGAGATCAAATCCAAAATTAAAAATAGACTGGAGGACCAAATTTTTTACCTTCAAACAAT

dot-bracket secondary structure
((((....(((.((((.......((((.(((((((((((((.((.(((((...((((.(((.((((((((((((((((((((.((.(((((....((.((
(.((((((((((.((((((.((((.(((..(((((.((((((.(((((.(((((((.(((((.((((.((.(((((((((((((.(((((((((((((((
(.((((((.((((((.(((((((((...((((..((((.....)))).))))....))))))..)))...)))))).)))))).))))))))))))))))
.)))))))))))))....)).)))).))))).)))))))..))))).)))))).)))))..))).)))).)))))).)))))))))).))).)).)))))
.))...)))))))))))))))))))).))).))))...))))).)).))))))))))))).))))..)))).))))))).....


SIMILARITIES
miRBase gma-MIR1520i: 5e-19

PMRD gma-miR1520a: 5e-16

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record




Liczniki na strone;