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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST003500
species: Glycine max
miRNA family: MIR1520
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Glycine max Glycine Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 AACGTGACACGTGACAGTCAA

miRNA*
 GATGGTCACGTGTCACGTTTG

mismatches: 1
bulges: 0
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pre-miRNA
 GTCTCTAATTTCGATTTTGATCTCTCTTTAAAATTATTCACGCATTGTCTTCCTTTTTTATTCAATCACGCACTCTTAGTTCCCAAGTCCAGATTTAGAT
ATTGACTGTTACAAAAGAATATTGATGGTCACGTGTCACGTTTGATTGAACGATAATTGCCACTTGTTATGTTCTGATTGACCAATGATTACAAGAATGC
ATTTCATCGTCCATCGAGTCAACATCTCATGACACGTGACAGTTATCGTCCAATCAGAACGTGACACGTGACAGTCAAAATTCATTTGTAACCGTCAACG
TCTAGATCTAGATTTGGAGATTAAGACTGAGTGATTGTATAAAAAAAAGACAAAATGCGTGAATAATTTGAAAGGGAGATCAAAATTGAAAATTAAAG

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase gma-MIR1520o: 0.00000000009

PMRD gma-miR1520b: 0.000001

microPC miR1520: 8e-79		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

Identical with: miR1520 from microPC (MNEST045438)

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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