ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: MIR437
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCAAAGTTAGAGAAGTTTTAA miRNA* CGAACTTCTCTAACTTTGACC mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTCCTCCATTCCAAATGTTAGGTCACTTTAGCTGTGTTGAGTCGAACTTCTCTAACTTTGACCACATTTATAATGGAATGCACCAATATCTACAACATTA
AATTCTTCATAAATTATGTCCTGATATAGCATTTATTTGAACATGTAGATGCCAATATATTTTTTTATAGACTTGGTCAAAGTTAGAGAAGTTTTAACTT
CGAAAAGATAAAGTGAAATATAATTTGGAACAGAGT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase sbi-MIR437t: 0.000003 PMRD zma-miR437c: 0.0000002 microPC miR437: 0.0007 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
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