ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: MIRf822
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGGACTAAACTTTAGTCCCTG miRNA* GGGACTAAAGTTTAGTCTCAT mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
TAGGGGGTTGTTTGGTTTCATGGGACTAAACTTTAGTCCCTGCCTTTTAGTCTATTTTAGTCCCTACATTACTAAATATAGGAAATAAAAGGGAATAAAT
CAGATTTCCTTCCCTCTCTTTAGTCCTATTTTTAGTAATTTAAGACTAAAAAAGAGGGACTAAAGTTTAGTCTCATAGAACCAAACATGCCCTA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD osa-miRf10823-akr: 0.0006 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
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