ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: MIRf25
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GTTCAAACATTCGATGTGATA miRNA* TCACATCAAGCGTTTGACTTT mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
TAATAGTATAATGAGGGGGTGTTTGGTTCTATGGACTAAAGTTTAGTCCGGGTCACATCAAGCGTTTGACTTTCAAATAGGAGTATGAAATATAGACCCA
ACCAACTGTACTAGATTCGTCTCACTTTTTAATCTTCGGCTGAGAAATTAGTTTTATAATCCGACTACATTTAATACCCCGAACGGAGGTTCAAACATTC
GATGTGATAGGGGCTAAATTTTAGCAGGGGCAAATCAAACACCCCCTGACTAATGACC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
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ACCAACTGTACTAGATTCGTCTCACTTTTTAATCTTCGGCTGAGAAATTAGTTTTATAATCCGACTACATTTAATACCCCGAACGGAGGTTCAAACATTC
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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