miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse

Back to search results



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST003598
species: Zea mays
miRNA family: MIR2504
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TTGATCAAGTTTATAGAAAAA

miRNA*
GTTCCTATAAATTTGGTTAAAT

mismatches: 1
bulges: 1

View larger
pre-miRNA
GTGACTACTCCCTCCCTATGTTTCATGTTATAAGTTGCTTTGATTTTTTTTCTAATCAAATTTCTTTAGATTTGATCAAGTTTATAGAAAAATATAATAA
TATTTTCAATACAAAATAGATATATTATCATAATATATTCAGCGTAATATTTAATAAAACTAATTTTGTGTTGTAAATGTTGCTAATTGTTCCTATAAAT
TTGGTTAAAT
CTATAGAAGTTTGACTACGAANAAAATCAAAAACAACTTATAAAATATAACACGGAGGAAGTATTAGC


dot-bracket secondary structure
.....((((.(((((...((((..((.((((((((((.(((((((((.(((.((.((((((((((.(((((((((((((((((((((((.(((.((.(((
(((((.(((((((((((((...(((((..(((.(((.......))).))).)))))...)).))))))))))).)))))))).))))).)).))))))))
))))))))))
))).)))))))))).)).))).)))))))))..)))))))))).))..)))).))))).)))).....



SIMILARITIES
miRBase sbi-MIR437d: 0.0002

PMRD sbi-miR437d: 0.0002

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
Source sequences
download this record





Liczniki na strone;