ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: MIRf420
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GACGAAGAAGAAGGTGATGAG miRNA* AAGTATCGTTTGGATTCTACGTG mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
GTGAAGGGGACGACGAAGAAGAAGGTGATGAGGAGGCTGAGGACGAAGATGTCGAAGCTGAGGATGACGAGCTTGACGCAGACGCAGAAGACAAGGAGAA
CATCGAAAGCAAGGCAGGATCTTCCCTGTTTTTAAGAGGAAAAGGAATAACGAGGATGATGCCAATGGATACAAGTAAAACGGTGAGGGGAAATAGTATT
TTCCTGAACTTCGGAAACGTTCCTGTTCACTGATTATTATTTGTATGCTTTTCGAGTATTTTTTCCCGCCTTGTAATAGACTAGAGCATAGTGTTTTTTA
GGCGATTCCATTTCTGAAGTATCGTTTGGATTCTACGTG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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GTGAAGGGGACGACGAAGAAGAAGGTGATGAGGAGGCTGAGGACGAAGATGTCGAAGCTGAGGATGACGAGCTTGACGCAGACGCAGAAGACAAGGAGAA
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TTCCTGAACTTCGGAAACGTTCCTGTTCACTGATTATTATTTGTATGCTTTTCGAGTATTTTTTCCCGCCTTGTAATAGACTAGAGCATAGTGTTTTTTA
GGCGATTCCATTTCTGAAGTATCGTTTGGATTCTACGTG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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HuntMi prediction: not a miRNA
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