ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GTACTCTATCCGTCCCAAATT miRNA* TTTAGGATGGAGTGAGTAATT mismatches: 5 bulges: 0 |
pre-miRNA
GACGGTGCCTAGTACTCTATCCGTCCCAAATTAAAATTCGTTTTACTTTTTTACTAGATTCATACAATAATTAATGTATGTGTTGTATATATATGTCTAG
GTTCATAATTATCTATATGAATGTGGACACAAAAATCTAGAGCTAAAACGACTATTATTTTAGGATGGAGTGAGTAATTGATACACT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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GTTCATAATTATCTATATGAATGTGGACACAAAAATCTAGAGCTAAAACGACTATTATTTTAGGATGGAGTGAGTAATTGATACACT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR819b: 0.0000006 PMRD osa-miR819b: 0.0000006 microPC miR446: 0.0001 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 0.00001 | most similar mature miRNAs |
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