ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: miR167g
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGTCATGCTGTAGTTTCATCT miRNA* GTGAAGCTGCCAGCATGATCTG mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
ATGTAGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTATGATGGTGGTGGTATATGTAAGATGGATGTAATCTATACTACTACCGGCCC
CTGTCACTCTCTCTCTCTCCCCCGTCCCTGACTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAGATGAGAGGGGAAGGGAGAGAGAGAGAGGGTAATTAATGAGC
ACCAGGACCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGCCGCACATCGAA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR167g: 2e-90 PMRD zma-miR167g: 2e-90 microPC miR167: 6e-20 | UniProt no hits RFAM MIR167_1: 1e-80 | most similar mature miRNAs |
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