ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: MIR156
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGACAGAAGAGAGTGAGCACA miRNA* TGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGT mismatches: 1 bulges: 2 |
pre-miRNA
AGCTAGGTGGTGGCGGCCGGCTGGGTTTTCGTTCCGTGGCTAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGGCAGACTGCATCGATCGATCTGCATCCGA
GACGGCGCACGTACGAATGATGATGCAGCTGCTGCTGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCAGTCCTCTAGCTGCTACGGCCTCTCTCCCGGCCTGCCACCA
CT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR156a: 1e-82 PMRD zma-miR156a: 1e-82 microPC miR156: 0.0000007 | UniProt no hits RFAM mir-156: 2e-26 | most similar mature miRNAs |
Identical with: zma-MIR156a from miRBase (MNEST042678) |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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