ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: miR159a
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GAGCTCCTATCATTCCAATGA miRNA* TGGATTGAAGGGAGCTCTG mismatches: 2 bulges: 2 |
pre-miRNA
CGATGCTTTGGGTTTGAAGCGGAGCTCCTATCATTCCAATGAAGGGTCGTTCCGAAGGGCTGGTTCCGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTATCCTATCTC
ATCTGGTGTATATATGTAATCCATGGGGGGGAGGGTTTCTCTCGTCTTTGAGATAAGGCCTTGTGGTTTGCATGACCGAGGAGCTGCACCGCCCCCTTGC
TGGGCGCTCTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCCTGATCCACCCTCC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR159a: 3e-102 PMRD zma-miR159a: 3e-102 microPC miR319: 9e-16 | UniProt no hits RFAM MIR159: 6e-79 | most similar mature miRNAs |
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